El Parque Nacional Molino de Flores está ubicado a tan sólo 3 km. al noreste de la Ciudad de Texcoco y a aproximadamente una hora de recorrido desde el centro de la Ciudad de México.
El acceso es por la autopista a Texcoco. Después de esta población tome el camino que conduce a San Miguel Tlaixapan y después de 3 km llegará a Molino de Flores.